Sự khác biệt giữa lai tạp khuẩn lạc và mảng bám
Mục lục:
- Lai ghép Thuộc địa là gì
- Lai ghép mảng bám là gì
- Điểm giống nhau giữa lai tạp khuẩn lạc và mảng bám
- Sự khác biệt giữa lai tạp khuẩn lạc và mảng bám
Các Sự khác biệt chính giữa sự lai tạo giữa khuẩn lạc và mảng bám là lai khuẩn lạc là phương pháp được sử dụng để chọn lọc các khuẩn lạc vi khuẩn có các gen mong muốn trong khi lai mảng là phương pháp chọn lọc các thể thực khuẩn có gen mong muốn. Hơn nữa, phép lai khuẩn lạc có thể được sử dụng trong việc sàng lọc các thư viện dựa trên plasmid– hoặc cosmid trong khi phép lai mảng bám có thể được sử dụng trong việc sàng lọc các thư viện phage.
Lai khuẩn lạc và lai mảng bám là hai kỹ thuật được sử dụng để sàng lọc các thư viện gen hoặc cDNA. Họ cũng được gọi là thang máy thuộc địa và nâng mảng bám tương ứng.
Thuộc địa, Thuộc địa lai, Sàng lọc thư viện, Mảng bám, Lai ghép mảng bám
Lai ghép Thuộc địa là gì
Lai khuẩn lạc là một phương pháp sàng lọc được sử dụng để lựa chọn các khuẩn lạc vi khuẩn có trình tự DNA mong muốn. Nó còn được gọi là lai colony blot, nâng khuẩn lạc hoặc bản sao mạ. Nó cho phép sàng lọc các khuẩn lạc được mạ với mật độ cao. Quy trình ban đầu của phép lai thuộc địa lần đầu tiên được phát triển bởi Grunstein và Hogness. Đầu tiên, các khuẩn lạc vi khuẩn có thể được biến đổi trên một màng và các khuẩn lạc vi khuẩn được ly giải, để lộ ra các axit nucleic. Sau đó, các axit nucleic tiếp xúc được cố định trên màng bằng cách làm biến tính chúng và được lai với các đầu dò phóng xạ.
Hình 1: Phương pháp lai khuẩn lạc
Khuẩn lạc là một cụm vi khuẩn được phát triển từ một tế bào vi khuẩn thông qua sinh sản vô tính. Do đó, tất cả các tế bào vi khuẩn trong một thuộc địa cụ thể có cùng cấu trúc gen cũng như vật chất di truyền đã biến đổi. Nói chung, vi khuẩn được biến nạp với sự hỗ trợ của vectơ plasmid hoặc cosmid.
Lai ghép mảng bám là gì
Lai mảng bám là phương pháp sàng lọc các phage tái tổ hợp. Nó là một sửa đổi của sự lai tạo khuẩn lạc bởi Benton và Devis vào năm 1977. Phương pháp này còn được gọi là nâng mảng bám. Quy trình lai mảng bám tương tự như quy trình lai khuẩn lạc và các mảng được nâng lên bằng cách tiếp xúc chúng với màng nitrocellulose. Các axit nucleic sau đó được tiếp xúc và cố định trên màng, lai với các đầu dò mong muốn.
Hình 2: Các mảng trên đĩa thạch
Mảng bám là một vùng rõ ràng trên đĩa thạch được tạo ra bởi một loại vi khuẩn cụ thể bằng cách ly giải các tế bào vi khuẩn trên vùng đó. Do lượng DNA chuyển vào màng nitrocellulose ít hơn, quá trình lai mảng bám tạo ra ít tín hiệu nền hơn.
Điểm giống nhau giữa lai tạp khuẩn lạc và mảng bám
Sự khác biệt giữa lai tạp khuẩn lạc và mảng bám
Sự định nghĩa
Lai khuẩn lạc đề cập đến một phương pháp chọn lọc các khuẩn lạc vi khuẩn với các gen mong muốn trong khi lai mảng bám đề cập đến một phương pháp sàng lọc được sử dụng để xác định các phage tái tổ hợp.
Được phát triển bởi
Phép lai khuẩn lạc lần đầu tiên được phát triển bởi Grunstein và Hogness trong khi phép lai mảng bám lần đầu tiên được phát triển bởi Benton và Devis vào năm 1977.
Các loại thư viện
Lai khuẩn lạc liên quan đến việc xác định các thư viện dựa trên plasmid hoặc cosmid trong khi lai mảng bám liên quan đến việc xác định các thư viện phage.
Số thang máy
Các khuẩn lạc có thể được nâng lên một lần trong khi các mảng có thể được nâng lên nhiều lần.
Tín hiệu nền
Phần kết luận
Lai khuẩn lạc là một phương pháp sàng lọc các khuẩn lạc vi khuẩn trong các thư viện được tạo ra với các vec tơ plasmid hoặc cosmid. Mặt khác, lai mảng bám là một phương pháp sàng lọc các thực khuẩn thể trong các thư viện của thể thực khuẩn. Sự khác biệt chính giữa lai khuẩn lạc và lai mảng bám là loại thư viện được sàng lọc trong mỗi phương pháp.
Thẩm quyền giải quyết:
1. Kaksonen, Anna. “Phương pháp tiếp cận phân tử để phân tích cộng đồng vi sinh vật.” Leaching - BioMineWiki, ngày 20 tháng 4 năm 2006, Có sẵn tại đây2. Dale, J W và P J Greenaway. “Xác định Phage Tái tổ hợp bằng Lai ghép mảng bám.” Các phương pháp trong Sinh học phân tử (Clifton, N.J.)., Thư viện Y khoa Quốc gia Hoa Kỳ, Có sẵn tại đây
Hình ảnh lịch sự:
1. “Blot Hybridization” của Kaksonen - http://wiki.biomine.skelleftea.se/biomine/molecular/index_22.htm (Public Domain) qua Commons Wikimedia 2. “M. mảng bám smegmatis ”của Wazzzup7up - Tác phẩm riêng (Miền công cộng) qua Commons Wikimedia