Các Sự khác biệt chính giữa exome và transcriptome là exome là trình tự hoàn chỉnh của tất cả các exon trong các gen mã hóa protein trong bộ gen trong khi bộ gen phiên mã là tập hợp các phân tử RNA thông tin có nguồn gốc từ các gen mã hóa protein. Hơn nữa, exome bao phủ 1-2% tổng số trình tự gen trong khi transcriptome chỉ chiếm ít hơn 4% tổng số RNA của tế bào.

Exome và transcriptome là hai tập hợp các trình tự trong gen mã hóa protein trong hệ gen. Cả hai đều có các ứng dụng khác nhau trong nghiên cứu bộ gen cũng như chẩn đoán bệnh.

Các lĩnh vực chính được bao phủ

1. Exome là gì - Định nghĩa, Sự kiện, Kỹ thuật 2. Transcriptome là gì - Định nghĩa, Sự kiện, Kỹ thuật 3. Điểm giống nhau giữa Exome và Transcriptome - Sơ lược các tính năng chung 4. Sự khác biệt giữa Exome và Transcriptome là gì - So sánh các điểm khác biệt chính

Điều khoản quan trọng

Exon, Exome, mRNA, Gen mã hóa protein, Phiên mã

Exome là gì

Exome là tập hợp các exon trong các gen mã hóa protein của bộ gen của một sinh vật cụ thể. Trình tự mã hóa của bộ gen được tập hợp thành các gen, có thể được mã hóa cho protein hoặc ARN. Trong hệ gen sinh vật nhân sơ, trình tự mã hóa không bị gián đoạn bởi các trình tự khác trong khi ở hệ gen nhân thực, trình tự mã hóa của gen bị gián đoạn bởi các trình tự không mã hóa gọi là intron. Do đó, các trình tự mã hóa nhóm được gọi là các exon.

Hình 1: Exon và Intron

Trong các gen mã hóa protein, RNA polymerase phiên mã intron cũng như exon vào mRNA tiền thân trong quá trình phiên mã. Các phần giới thiệu được kết hợp sẽ bị loại bỏ trong các lần sửa đổi sau phiên mã sau. Công nghệ chính được sử dụng trong nghiên cứu exome là giải trình tự toàn bộ exome (WES). WES tham gia vào quá trình lai DNA bị phân mảnh của một bộ gen cụ thể để xác định các trình tự DNA mục tiêu sau khi giải trình tự.

Transcriptome là gì

Bộ phiên mã là tổng số mRNA được biểu hiện trong một tế bào. Nó chiếm ít hơn 4% tổng số RNA của tế bào. Vì transcriptome xác định thành phần của proteome, nó quyết định khả năng sinh hóa của tế bào cụ thể đó. Ngoài ra, bản sao của một tế bào cụ thể không thể được tổng hợp và nó luôn đến tế bào con từ tế bào mẹ trong quá trình phân chia tế bào. Vì vậy, phiên mã, là quá trình sản xuất ARN, là bước duy trì bộ phiên mã.

Hình 2: Phiên mã của Tế bào vạn năng

Mặt khác, mặc dù mỗi tế bào chứa thông tin để sản xuất toàn bộ hệ thống phiên mã của loài, các gen biểu hiện trong tế bào cũng phụ thuộc vào các yếu tố môi trường. Hai công nghệ chính được sử dụng trong nghiên cứu transcriptomes là microarray và RNA-seq.

Điểm giống nhau giữa Exome và Transcriptome

Sự khác biệt giữa Exome và Transcriptome

Sự định nghĩa

Exome đề cập đến một phần của bộ gen bao gồm các exon, mã thông tin để tổng hợp protein trong khi transcriptome đề cập đến tổng số tất cả các phân tử ARN thông tin được biểu hiện trong gen của một sinh vật. Do đó, sự khác biệt chính giữa exome và transcriptome có thể tự giải thích từ định nghĩa này.

Ý nghĩa

Do đó, exome là tổng số exon trong các gen mã hóa protein trong khi transcriptome là tổng số mRNA được biểu hiện trong tế bào.

DNA hoặc RNA

Ngoài ra, exome được tạo thành từ DNA trong khi transcriptome được tạo thành từ RNA.

Số lượng

Exome đại diện cho 1-2% tổng bộ gen trong khi transcriptome đại diện cho ít hơn 4% tổng số RNA của tế bào.

Cấp độ

Một sự khác biệt khác giữa exome và transcriptome là exome ở cấp độ bộ gen trong khi transcriptome ở cấp độ phiên mã.

Kỹ thuật

Hơn nữa, giải trình tự toàn bộ exome là kỹ thuật để xác định exome trong khi microarray và RNA-seq xác định transcriptome.

Phần kết luận

Exome là toàn bộ tập hợp các exon trong bộ gen được xác định bởi WES của bộ gen. Do đó, exome là một khái niệm dựa trên DNA. Nhưng, transcriptome là một khái niệm dựa trên RNA vì nó là toàn bộ bộ mRNA của tế bào. Sự khác biệt chính giữa exome và transcriptome là khái niệm của chúng.

Thẩm quyền giải quyết:

1. Warr, Amanda và cộng sự. “Sắp xếp theo trình tự Exome: Viễn cảnh hiện tại và tương lai.” G3: Gen | Hệ gen | Di truyền 5.8 (2015): 1543–1550. PMC. Web. Ngày 6 tháng 9 năm 2018. Có sẵn tại đây2. TA nâu. Bộ gen. Ấn bản lần 2. Oxford: Wiley-Liss; 2002. Chương 3, Transcriptomes và Proteomes. Có sẵn tại đây

Hình ảnh lịch sự:

1. “DNA exons intns” của Viện nghiên cứu bộ gen người quốc gia - (Public Domain) qua Commons Wikimedia 2. “Bộ phiên mã của tế bào đa năng” của Grskovic, M. và Ramalho-Santos, M., Bộ phiên mã đa năng (10 tháng 10, 2008), StemBook, biên tập. Cộng đồng Nghiên cứu Tế bào gốc, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Hình 2 Bộ phiên mã của tế bào đa năng.Grskovic, M. và Ramalho-Santos, M., Bộ phiên mã đa năng (10 tháng 10 năm 2008), StemBook, ed. Cộng đồng Nghiên cứu Tế bào gốc, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. (CC BY 3.0) qua Commons Wikimedia